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19405301 Vorlesung

Advanced Algorithms in Bioinformatics

Knut Reinert

Kommentar

Ziele:

Die Studentinnen und Studenten erlangen ein tieferes Verständnis für grundlegende algorithmische Konzepte im Bereich der Analyse genomischer Sequenzen vor dem Hintergrund aktueller Forschungsrichtungen der Bioinformatik und Biotechnologie. Sie verstehen verschiedene Paradigmen zur approximativen Suche, sie wissen, unter welchen Voraussetzungen bestimmte Algorithmen anderen vorzuziehen sind, und können wissenschaftliche Publikationen auf dem Gebiet entsprechend einschätzen.

Es werden vertieft Themen aus beispielsweise folgenden Gebieten behandelt:

  • Paradigmen für approximative, semiglobale Alignments (read mapping)
  • Methoden zur Genomassemblierung und Metagenomassemblierung
  • Methoden zum Bestimmen genetischer Variationen (SNVs, SNPs, CNVs)
  • Algorithmische Probleme bei der Quantifizierung mit Hilfe von NGS Daten

Alle weiteren Informationen im Whiteboard: https://mycampus.imp.fu-berlin.de/portal

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14 Termine

Regelmäßige Termine der Lehrveranstaltung

Di, 10:00 - 12:00 Advanced Algorithms in Bioinformatics 14 Termine
Di, 16.04.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 23.04.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 30.04.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 07.05.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 14.05.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 21.05.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 28.05.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 04.06.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 11.06.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 18.06.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 25.06.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 02.07.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 09.07.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Di, 16.07.2024 10:00 - 12:00
Advanced Algorithms in Bioinformatics

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

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Ort: T9/046 Seminarraum (Takustr. 9)

Zeit: Di 10:00-12:00

Erster Termin: 16.04.2024

Unterrichtssprache: Englisch

SWS: 2

Teilnehmerzahl: 30

Platzbeschränkung: Ja

Teilnahmepflicht: Nein

Fachsemester: 2

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