AG Keller "Molecular Dynamics''

https://www.bcp.fu-berlin.de/en/chemie/chemie/forschung/PhysTheoChem/agkeller/index.html

Die AG Keller beschäftigt sich mit der Modellierung und Simulation von Molekulardynamik. Ein besonderer Fokus liegt dabei auf multiskaligen System und Systemen, deren Dynamik durch seltene Ereignisse bestimmt ist. Durch dieses Themengebiet ergibt sich eine sehr interdisziplinäre Arbeitsweise, bei der Methoden aus der Mathematik und der Physik auf chemische Fragestellungen angewandt werden. Eine Stoffgruppe, mit der sich die AG Keller vertieft beschäftigt, sind selbst-assemblierende biomimetische Hydrogele. Dabei interessiert uns, wie die makroskopischen viskoelastischen Eigenschaften der Hydrogele, durch ihre mikroskopische Struktur und Dynamik entstehen.

Aufgabengebiet:
Mitarbeit in der Lehre und Forschung:

Das Forschungsprojekt soll in enger Zusammenarbeit mit dem Projekt C02 im SFB 1449 durchgeführt werden. Konkret soll der Assemblierungsprozess von Dipeptid-Hydrogelen mit coarse-grained und mit atomistischen Simulationen unter verschiedenen Bedingungen (pH-Wert, Ionenstärke, Temperature) modelliert werden. Aus diesen Simulationen sollen dynamische Größen (z.B. Diffusion, Viskosität, konformationelle Dynamik), wie sie sich aus der Green-Kubo-Relation ergeben, bestimmt werden. Ziel ist es, des Projektes ist es, ein Modell zu erstellen, das erklärt, wie die makroskopischen Eigenschaften des Hydrogels von den Umgebungsbedingungen beeinflusst wird.
Die Tätigkeit dient der eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung (Promotion).

Einstellungsvoraussetzungen:
Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master/Diplom) in Chemie, Physik oder einem verwandten Fach.

Erwünscht:

- Erfahrung in der Modellierung und Simulation molekularer Systeme;
Programmiererfahrung, vorzugsweise in Python
- LaTex-Kenntnisse- Ausbildung in statistischer und computergestützter Physik
- Erfahrung mit Coarse-Grained-Simulation
- Erfahrung mit der Beschreibung der dynamischen Größen in molekularen Systemen (z.B.
Diffusion, Viskosität, konformationelle Dynamik)

Weitere Informationen erteilt Frau Prof. Dr. Bettina Keller (bettina.keller@fu-berlin.de/ 838 50614).