Die Arbeitsgruppe Absmeier (https://www.bcp.fu-berlin.de/en/chemie/biochemie/research-groups/absmeier-group/index.html) beschäftigt sich mit der Regulation von Boten-RNS Translation und deren Abbau. Boten-RNS Abbau ist ein wichtiger Mechanismus zur Kontrolle der Genexpression und stellt eine schnelle Translatomänderung nach bestimmten Signalen sicher. Kanonischer Boten-RNS Abbau beginnt in den meisten Fällen mit dem Entfernen des poly(A) Schwanzes am 3´ Ende durch Deadenylasen, wie z.B. dem CCR4-NOT Proteinkomplex. Gezielter Abbau von bestimmten Boten-RNS Molekülen wird durch Adaptorproteine erwirkt, welche spezifisch an eine Boten-RNS binden und dann den CCR4-NOT Komplex rekrutieren. Solche Adaptorproteine sind z.B. MEX3 Proteine, welche zusätzlich zu ihrer RNS-Bindedomäne noch ein E3-Ubiquitinligasedomäne besitzen. MEX3 ubiquitiniert die katalytisch aktive CNOT7/8 Deadenylaseuntereinheit des CCR4-NOT Komplexes. Dies führt zu schnellerem Abbau von bestimmten Boten-RNS Molekülen und dies wiederum zur, z.B., Aktivierung von natürlichen Killerzellen oder zur Umgehung des Immunsystems durch Krebszellen. Die molekularen Details wie MEX3 Proteine CCR4-NOT rekrutieren und wie Ubiquitinierung den Boten-RNS Abbau stimuliert sind bisher nicht verstanden. Die hier ausgeschriebene Stelle ist vorbehaltlich der Mittelvergabe.

Aufgabengebiet:
Mitarbeit im Teilprojekt (The MEX3 protein family of RNA binding E3 ligases- a switch for controlling rapid mRNA decay) des DFG-geförderten Transregio 186 (Molecular switches in the spatio-temporal control of cellular signal transmission).

Einstellungsvoraussetzungen:
Abgeschlossenes wiss. Hochschulstudium (Master, Diplom) im Fachgebiet Biochemie oder einer verwandten Lebenswissenschaft.

Erwünscht:
Bewerber*innen sollten ein gutes Verständnis und experimentelle Erfahrung in Proteinbiochemie und/oder Strukturbiologie mitbringen. Das Projekt beinhaltet rekombinante Expression von Proteinen und Proteinkomplexen (in Bakterien oder Insektenzellen), Protein-Protein oder Protein-RNS Interaktionsstudien, funktionelle Studien (z.B. in vitro Deadenylierung und Ubiquitinerung) und strukturelle Untersuchungen. Zusätzlich sollen in cellulo Studien durchgeführt werden um z.B. Ergebnisse von strukturellen und funktionellen Studien zu testen und um neue Interaktionspartner zu identifizieren.

Folgende Kenntnisse und Fertigkeiten sind besonders erwünscht:
* Molekularbiologische Techniken (z.B. molekulare Klonierung, gerichtete Mutagenese)
* Produktion rekombinanter Proteine in Escherichia coli und Insektenzellen
* Charakterisierung von Proteinen, Nukleinsäuren und ihren Interaktionen über biochemische und biophysikalische Verfahren (z.B. analytische Gelfiltrationschromatographie, Pulldowns)
* Erfahrung in der Strukturanalyse von biologischen Makromolekülen und ihren Komplexen über Röntgenkristallographie, Elektronen-kryomikroskopische Verfahren oder Crosslinking-Massenspektrometrie
* Erfahrung in humaner Zellkultur

Bewerbungen sollten Studienunterlagen, die Namen von zwei Gutachter*innen für Empfehlungsschreiben, ein Motivationsschreiben und einen Lebenslauf unter Angabe der Referenz: Absmeier_TRR186_DE enthalten und sind zu senden an eva.absmeier@fu-berlin.de

Weitere Informationen erteilt Frau Dr. Eva Absmeier (eva.absmeier@fu-berlin.de/ 03083850508).