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Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie - Institut für Chemie und Biochemie AG Keller "Molecular Dynamics

Wiss. Mitarbeiter*in (m/w/d) mit 65%-Teilzeitbeschäftigung befristet bis 31.12.2024 (Projektende) Entgeltgruppe 13 TV-L FU Kennung: SFB1114-B05-2024

Bewerbungsende: 19.08.2024

Mit der Mathematik als der leitenden Disziplin eines ansonsten interdisziplinär ausgerichteten Programms zielt der SFB 1114 „Skalenkaskaden in komplexen Systemen“ auf methodische Entwicklungen zur Erforschung von komplexen Prozessen ab, die ganze Kaskaden von Skalen enthalten. Solche Prozesse sind durch mehr als zwei charakteristische Skalen, einen großen Unterschied zwischen der kleinsten und größten Skala sowie durch physikalische Interaktionen über die Skalenhierarchie hinweg gekennzeichnet. Dabei orientieren sich die Forschungsgruppen an herausfordernden Anwendungen, hauptsächlich aus den Lebens- und Geowissenschaften, und verfolgen das Doppelziel, sowohl zu den Anwendungsfragestellungen als auch zur Bereitstellung verallgemeinerungsfähiger Methoden der mathematischen Modellierung substanziell beizutragen.

Aufgabengebiet:
Das Projekt B05 des SFB1114 befasst sich mit der Konstruktion von dynamischen Mehrskalenmodellen für komplexe molekulare Prozesse unter Verwendung von dynamischen Umgewichtungsmethoden und einer direkten Diskretisierung der Fokker-Planck-Gleichung (square-root approximation). In der ausgeschriebenen Stelle soll das das Unterprojekt WP3 “Application to receptor-ligand binding” bearbeitet werden. Konkret sollen dynamische Größen (z.B. Diffusion, Viskosität, konformationelle Dynamik), wie sie sich aus der Green-Kubo-Relation ergeben, mit Hilfe von molekulardynamischen Simulationen und den oben genannten Methoden modelliert werden.

Einstellungsvoraussetzungen:
Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (M.Sc. oder Diplom) in Chemie, Physik oder einem verwandten Fach

Erwünscht:
- Erfahrung in der Modellierung und Simulation molekularer Systeme
-Programmiererfahrung, vorzugsweise in Python
- LaTeX-Kenntnisse
- Erfahrung in statistischer und computergestützter Physik
- Erfahrung mit Coarse-Grained-Simulation
- Erfahrung mit der Beschreibung der dynamischen Größen in molekularen Systeme (z.B. Diffusion, Viskosität, konformationelle Dynamik)

Stellenausschreibung vom: 28.07.2024

Schlagwörter

  • Biologie, Chemie, Pharmazie