Der Botanische Garten mit dem Botanischen Museum (Bo Berlin) ist als Zentraleinrichtung der Freien Universität Berlin eine Sammlungs- und Forschungseinrichtung mit Bildungsauftrag und zählt zu den fünf größten Botanischen Gärten weltweit. Der Bo Berlin zeichnet sich durch international vernetzte Forschung auf den Gebieten der Botanik und Biodiversität aus. Als Mitarbeiter*in des Bo Berlin können Sie ein Teil davon werden!

Für das DFG-finanzierte Projekt „Eine neue Geschichte von Herbarium Sammlungen erzählt - Entschlüsselung der Muster der klonalen Diversität“ suchen wir Unterstützung. Obwohl meist nicht mit dem Ziel der Dokumentation der Variabilität von Populationen angelegt, enthalten naturhistorische Sammlungen und große Herbarien besonders vielfach wertvolle Informationen, die man mit modernen analytischen Methoden erforschen kann („Herbariomics“). In diesem Projekt wird die apomiktische Potentilla praecox F.W.Schultz als Modell verwendet, um die Effekte der Mutationsakkumulation und deren evolutionärer Konsequenzen mittels populationsgenomischer Methoden zu untersuchen. Das Projekt hat zum Ziel, folgende Hypothesen zu testen: 1. Mutationen sind ungleichmäßig im Genom verteilt. 2. Phänomene, welche die Mutationslast verstärken, sind auf kurzen Zeitskalen aktiv, 3. Mutationsakkumulation über die letzten 150 Jahren führten zum Aussterben von bestimmten Linien von P. praecox.

Aufgabengebiet:
Assemblierung eines Referenzgenoms aus der Kombination von PacBio (HiFi)-, Illumina- und eventuell Hi-C und Bionano-Daten; SNP-basierte populationsgenomische Analysen der historisch definierten Populationen; Auswertung und Interpretation der Ergebnisse, Publikation der Daten, Planung und Unterstützung der Laborarbeiten

Einstellungsvoraussetzungen:
Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in Biologie, Bioinformatik oder einem vergleichbaren Fachgebiet

Erwünscht:
praktische Erfahrung mit Next-Generation-Sequencing-Methoden der Evolutionsforschung; gute Kenntnisse in Shellscript- und Python-Programmierung und R, Erfahrung mit Assemblierung von (pflanzlichen) Genomen und populationsgenomischen Analysen; sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift; ausgeprägte kommunikative Fähigkeiten; Erfahrung mit molekular-genetischen Labortechniken