19400001 Vorlesung

WiSe 22/23: Algorithmen und Datenstrukturen

Knut Reinert

Kommentar

In der Vorlesung werden folgende Inhalte behandelt: Exaktes und approximatives String Matching, Dynamische Programmierung und Scoring Schemata, endliche Automaten und formale Sprachen, paarweises und multiples Alignment, multiples String Matching, Grundlagen von Markovketten und Hidden Markov Models, Algorithmen zur schnellen Suche in Sequenz-Datenbanken.

In den Übungen werden die erarbeiteten Inhalte vertieft und Analyse- und Beweistechniken eingeübt.

Das "Praktikum: Algorithmen und Datenstrukturen" (19401330) ist dieser Lehrveranstaltung angegliedert. Bitte informieren Sie sich auch auf der dortigen Seite!

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Literaturhinweise

Generelle Bücher/Basic reading:

  • Neil C. Jones, Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. MIT Press, Cambridge, MA, 2004. ISBN 0-262-10106-8
  • R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press, 1998. ISBN 0-521-62971-3
  • David B. Mount: Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2001. ISBN 0-87969-608-7
  • Chao, Zhang: Sequence comparison, Theory and Methods: Springer, ISBN: 978-1-85800-319-4
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16 Termine

Regelmäßige Termine der Lehrveranstaltung

Do, 20.10.2022 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/SR 005 Übungsraum (Takustr. 9)

Do, 27.10.2022 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/SR 005 Übungsraum (Takustr. 9)

Do, 03.11.2022 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

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T9/SR 005 Übungsraum (Takustr. 9)

Do, 10.11.2022 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

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Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

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T9/SR 005 Übungsraum (Takustr. 9)

Do, 17.11.2022 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

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Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

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T9/SR 005 Übungsraum (Takustr. 9)

Do, 24.11.2022 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

Dozenten:
Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

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T9/SR 005 Übungsraum (Takustr. 9)

Do, 01.12.2022 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

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Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

Räume:
T9/SR 005 Übungsraum (Takustr. 9)

Do, 08.12.2022 14:00 - 16:00
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Do, 15.12.2022 14:00 - 16:00
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Do, 05.01.2023 14:00 - 16:00
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Do, 12.01.2023 14:00 - 16:00
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Do, 19.01.2023 14:00 - 16:00
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Do, 26.01.2023 14:00 - 16:00
Algorithmen und Datenstrukturen

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Do, 02.02.2023 14:00 - 16:00
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Do, 09.02.2023 14:00 - 16:00
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Do, 16.02.2023 14:00 - 16:00
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Prof. Dr.-Ing. Knut Reinert

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