19400001
Vorlesung
Algorithmische Bioinformatik I und Numerik
Knut Reinert
Kommentar
In der Vorlesung werden folgende Inhalte behandelt: Methoden der approximativen Sequenzsuche und des Sequenzvergleiches. Unter anderem, indexbasierte Suchen, multiple Suchen und Heuristiken zur Sequenzsuche. Im Bereich Numerik werden Rundungsfehler, Kondition, Stabilität, Vektor- und Matrixnormen sowie das Gauss-Verfahren und die LR Zerlegung behandelt.
In den Übungen werden die erarbeiteten Inhalte vertieft und Analyse- und Beweistechniken eingeübt.
Das Modul "Praxis der Algorithmischen Bioinformatik I und Numerik" (19401330) ist dieser Lehrveranstaltung angegliedert. Bitte informieren Sie sich auch auf der dortigen Seite!
SchließenLiteraturhinweise
Generelle Bücher/Basic reading:
- Neil C. Jones, Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. MIT Press, Cambridge, MA, 2004. ISBN 0-262-10106-8
- R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press, 1998. ISBN 0-521-62971-3
- David B. Mount: Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2001. ISBN 0-87969-608-7
- Chao, Zhang: Sequence comparison, Theory and Methods: Springer, ISBN: 978-1-85800-319-4
16 Termine
Regelmäßige Termine der Lehrveranstaltung
Do, 17.10.2024 12:00 - 14:00
Do, 24.10.2024 12:00 - 14:00
Do, 31.10.2024 12:00 - 14:00
Do, 07.11.2024 12:00 - 14:00
Do, 14.11.2024 12:00 - 14:00
Do, 21.11.2024 12:00 - 14:00
Do, 28.11.2024 12:00 - 14:00
Do, 05.12.2024 12:00 - 14:00
Do, 12.12.2024 12:00 - 14:00
Do, 19.12.2024 12:00 - 14:00
Do, 09.01.2025 12:00 - 14:00
Do, 16.01.2025 12:00 - 14:00
Do, 23.01.2025 12:00 - 14:00
Do, 30.01.2025 12:00 - 14:00
Do, 06.02.2025 12:00 - 14:00
Do, 13.02.2025 12:00 - 14:00