21604a
Lecture
SoSe 24: Biochemistry IV - Methods in Biochemistry
Christian Freund, Petra Knaus, Markus Wahl, Helge Ewers, Florian Heyd, Tarek Hilal, Bernhard Loll
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Modul: Biochemie IV (6 LP)
Qualifikationsziele: Das Modul vertieft die in den Modulen "Biochemische Methoden und Nukleinsäuren", "Proteine und Enzymkinetik" und "Lipide und Kohlenhydrate" erworbenen Kenntnisse über grundlegende Methoden. Nach Abschluss des Moduls besitzen die Teilnehmerinnen bzw. Teilnehmer umfangreiche Kenntnisse über aktuelle Methoden, die in der biochemischen Forschung zum Einsatz kommen. Die Teilnehmerinnen bzw. Teilnehmer sind in der Lage, fachspezifische experimentelle Fragestellungen zu erkennen und weitergehende Forschungsansätze konzeptionell zu entwerfen.
Inhalte: Grundlagen NMR, NMR-Resonanz-Zuordnungen, NMR-Strukturbestimmung, Messung von Strukturänderungen (Dynamik), Quartärstrukturbestimmung, H/D-Austausch
Röntgenkristallographie, Faltungsanalyse, Protein-Engeneering
Isolierung und Synthese von Nukleinsäuren, Hybridisierungs- und Nachweistechniken, DNA-Sequenzierung und Methylierungsanalyse, Funktionelle Genomanalyse, DNA-Microarrays
Grundlagen der Spektroskopie, Lambert-Beer, Infrarotspektroskopie, Circulardichroismus, Grundlagen der (biologischen) Fluoreszenz, Grundlagen der Fluoreszenzmikroskopie, Moderne Mikroskopiemethoden in der Zellbiologie, Grundlagen der digitalen Bildgebung und quantitativen Mikroskopie
Mutagenese/Klonierung von Expressionskonstrukten, Transfektion von Zellen, Subzelluläre Fraktionierung, Immunpräzipitation/GST Pulldown, Reportergenanalysen, Immunfluoreszenz-mikroskopie/FRET, shRNA, siRNA, miRNAs, Methoden zur Proliferations- und Apoptosemessung
Charakterisierung von Kohlenhydratkomponenten über chromatographische, enzymatische und massenspektrometrische Methoden, Proteomics (Massenspektrometrie: MALDI-MS, Orbitrap); Proteinsequenzierung; Analytik post-translationaler Modifikationen; Sequenzdaten-analyse, FRET; ELISA; Kinetik makromolekularer Interaktionen (BIACORE)
Prof. Dr. H. Ewers: helge.ewers@fu-berlin.de
Prof. Dr. C. Freund: chfreund@zedat.fu-berlin.de
Prof. Dr. F. Heyd: florian.heyd@zedat.fu-berlin.de
Prof. P. Knaus: knaus@chemie.fu-berlin.de
Dr. B. Loll: loll@chemie.fu-berlin.de Prof. M. Wahl: mwahl@chemie.fu-berlin.de close
Qualifikationsziele: Das Modul vertieft die in den Modulen "Biochemische Methoden und Nukleinsäuren", "Proteine und Enzymkinetik" und "Lipide und Kohlenhydrate" erworbenen Kenntnisse über grundlegende Methoden. Nach Abschluss des Moduls besitzen die Teilnehmerinnen bzw. Teilnehmer umfangreiche Kenntnisse über aktuelle Methoden, die in der biochemischen Forschung zum Einsatz kommen. Die Teilnehmerinnen bzw. Teilnehmer sind in der Lage, fachspezifische experimentelle Fragestellungen zu erkennen und weitergehende Forschungsansätze konzeptionell zu entwerfen.
Inhalte: Grundlagen NMR, NMR-Resonanz-Zuordnungen, NMR-Strukturbestimmung, Messung von Strukturänderungen (Dynamik), Quartärstrukturbestimmung, H/D-Austausch
Röntgenkristallographie, Faltungsanalyse, Protein-Engeneering
Isolierung und Synthese von Nukleinsäuren, Hybridisierungs- und Nachweistechniken, DNA-Sequenzierung und Methylierungsanalyse, Funktionelle Genomanalyse, DNA-Microarrays
Grundlagen der Spektroskopie, Lambert-Beer, Infrarotspektroskopie, Circulardichroismus, Grundlagen der (biologischen) Fluoreszenz, Grundlagen der Fluoreszenzmikroskopie, Moderne Mikroskopiemethoden in der Zellbiologie, Grundlagen der digitalen Bildgebung und quantitativen Mikroskopie
Mutagenese/Klonierung von Expressionskonstrukten, Transfektion von Zellen, Subzelluläre Fraktionierung, Immunpräzipitation/GST Pulldown, Reportergenanalysen, Immunfluoreszenz-mikroskopie/FRET, shRNA, siRNA, miRNAs, Methoden zur Proliferations- und Apoptosemessung
Charakterisierung von Kohlenhydratkomponenten über chromatographische, enzymatische und massenspektrometrische Methoden, Proteomics (Massenspektrometrie: MALDI-MS, Orbitrap); Proteinsequenzierung; Analytik post-translationaler Modifikationen; Sequenzdaten-analyse, FRET; ELISA; Kinetik makromolekularer Interaktionen (BIACORE)
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